福建商学院机关党委目前覆盖23个机关处室、4个教辅单位、3个教学单位共27个党支部。分别是：

党政办公室党支部、组织部党支部、宣传部党支部、统战部（校友会、基金会）党支部、纪委综合室纪检监察室党支部、学生工作部党支部、教师工作部党支部、机关党委党支部、人事处党支部、教务处党支部、质量监控与评估处党支部、财务处党支部、科研处党支部、后勤管理处党支部、基建处党支部、安全保卫处（武装部）党支部、资产管理处党支部、发展规划处对外合作处党支部、工会与审计处党支部、团委党支部、图书馆党支部、信息技术中心党支部、继续教育学院党支部、通识教育学院党支部、体育教学部党支部、实验实训中心党支部、创新创业教育中心党支部。
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